对于蛋白尿的治疗效果，临床上差异非常复杂，因为导致蛋白尿的疾病也比较多，包括原发性肾小球疾病，如急性肾炎、慢性肾炎、肾病综合征、急进性肾炎、隐匿性肾炎等，还有糖尿病肾病、高血压肾损害、止痛药性肾脏病等等，都会导致蛋白尿。导致蛋白尿的病理类型也有很多，所以对于蛋白尿的治疗效果取决于原发疾病及病理类型。
急性肾炎和急进性肾炎导致的蛋白尿，治疗效果比较好，通过利尿消肿、对症治疗以后可以完全消失。而肾病综合征导致蛋白尿，必须根据病理类型进行对症处理，使尿蛋白缓解，微小病变型、轻度系膜增生型、早期膜性肾病治疗效果较好。糖尿病肾病的蛋白尿治疗比较困难，因为在有高血糖的参与下，大量蛋白尿会使肾脏的负担加重，用药治疗效果较差。