输尿管炎需要与输尿管阴性结石、输尿管肿瘤、下腔静脉后输尿管进行鉴别。
1、输尿管阴性结石：输尿管阴性结石与输尿管炎都属于同器官性病变，前者相对于后者，会出现明显性腰痛症状，通过超声影像检查可以观察到不同程度肾积水，而后者一般不具有此类病症表现。
2、输尿管肿瘤：输尿管肿瘤属于肿瘤性病变，其症状表现与输尿管炎患者具有一定相似性，但是通过超声影像检查可观察肾积水迹象，并且通过尿液培养检查可以发现脱落细胞存在。
3、下腔静脉后输尿管：下腔静脉后输尿管与输尿管炎需要通过CT、MRI等医学影像检查镜像鉴别诊断。下腔静脉后输尿管医学图像可以观察到“S”状异型，并且伴随有不同程度的肾积水。