慢性肾脏病需要与急性肾功能衰竭、肾小球滤过率生理性偏高、肾素分泌肿瘤进行鉴别。
1、急性肾功能衰竭：急性肾功能衰竭患者会在数天或者数周内出现肌酐水平异常升高现象，此病发病更急，但是有可逆性，可通过肾活检进行鉴别诊断。急性肾功能衰竭患者部分还会伴随有发烧、皮疹、多关节痛等典型症状。
2、肾小球滤过率生理性偏高：部分正常人群，由于各种原因会出现有暂歇性肾小球滤过率偏高的情况。所以临床诊断上要配合其他检查加以区别。
3、肾素分泌肿瘤：部分肾素分泌肿瘤会严重影响肾功能，继而引起类似于慢性肾脏病的症状表现。但是通过肾脏超声检查可以较为容易与之进行鉴别。