蝶窦囊肿是不会自己消失的。蝶窦囊肿是一种外面有完整包膜包绕的良性肿瘤，包膜里面是大量液体成分，由于有完整包膜的存在，包膜内液体不会被周围组织吸收，也一般不会自行减小或扩大，因此蝶窦囊肿是不会自己消失的。蝶窦囊肿是一种良性肿瘤，如果没有引起明显症状如长期头疼不适，可不用处理，如果蝶窦囊肿引起了头疼，可给予手术切除蝶窦囊肿。