寰枢椎旋转脱位患者一旦出现症状，应及时就医，以免迁延日久，复位困难。治疗方法的选择应依据病变情况而定，治疗方法有保守治疗和手术治疗。
一、保守治疗
1、对因治疗：在儿童寰枢脱位，多与上呼吸道及头颈部感染有关，对尚存在的感染应选用有效的抗生素，口服或肌注，以控制感染。
2、手法及牵引复位：对病程短、症状轻者，可由有经验的医师手法治疗，但多主张选用较稳妥的牵引复位固定。对病程短者，先用枕颌带牵引，牵引重量按年龄用3~5kg，如三日内不能复位，则应改颅骨牵引。经照片证实已复位后，改用头颈胸石膏固定3~4周，对成人亦可用寰枢椎固定术。
二、药物治疗
1、抗上呼吸道感染药物：
（1）抗生素：细菌感染性上呼吸道感染使用抗生素，根据不同类型的细菌感染选择不同的抗生素。小儿最常见的链球菌感染扁桃体炎使用青霉素或阿莫西林，但注意是否药物过敏，药物过敏者禁用。
（2）抗病毒药物：小儿上呼吸道感染还常见于流感，可采用奥司他韦，注意肝肾功能不全患者慎用。
2、镇痛药：
（1）布洛芬：当患者疼痛不缓解并影响正常生活时，可适当给予布洛芬缓解疼痛，但注意药物过敏者禁用，接受冠状动脉旁路移植术者禁用。
三、手术治疗
后路切开复位同时行寰枢关节融合术：1、适用于慢性(3个月以上)或不可复位的旋转脱位，伴有颅底凹陷等其他畸形时，复发的旋转脱位，存在神经功能损害，横韧带不完整的患者。
2、优点为解除疼痛和肌肉痉挛，不对称的面部术后可逐渐恢复，一般不再复发脱位，旋转畸形时扭转的椎动脉被松解，视轴也可逐渐调整至正常。
3、缺点是损失了关节活动度，不可避免的出现寰枕关节松弛，和加速枢椎以下关节的退行性变，儿童患者融合节段垂直方向会出现生长受限。