小儿慢性粒细胞白血病一般慢性期发病缓慢，开始时症状较轻，表现为乏力、体重减轻、夜间盗汗、骨关节疼、左上腹饱满不适。绝大多数患儿可有巨牌、肝脏肿大、淋巴结轻度肿大、视神经乳头水肿等，个别患者可出现感染、髓外浸润等并发症。
1、慢性期：一般持续1~4年，病人有乏力、低热、多汗或盗汗、体重减轻等代谢亢进的症状。由于脾大而自觉有左上腹坠胀感，常以脾大为最显著体征，往往就医时已达脐或脐以下，质地坚实、平滑、无压痛。如果发生脾梗死，则脾区压痛明显，并有摩擦音。肝脏明显肿大较少见，部分病人胸骨中下段压痛。当白细胞显著增高时，可有眼底充血及出血，白细胞极度增高时可发生白细胞淤滞症。
2、加速期：加速期可维持几个月到数年，常有发热、虚弱进行性体重下降、骨骼疼痛，逐渐出现贫血和出血，脾持续或进行性肿大，对原来治疗有效的药物，包括酪氨酸激酶抑制剂无效中期症状。
3、急变期：为小儿慢性粒细胞白血病终末期，多数急粒变，少数为急淋变或急单变。临床表现与急性白血病相似，贫血、出血、发热，肝、脾肿大，并可伴有其他髓外浸润灶，预后极差，往往在数个月内死亡。