当病人的游离前列腺特异性抗原的数值偏高时，要给予高度重视，因为游离前列腺特异性抗原的偏高，可能会提示着前列腺恶性肿瘤的可能。此时需要进一步地检查总前列腺特异性抗原，并且要计算游离前列腺特异性抗原和总前列腺特异性抗原的比值。
如果二者的比值显著增高，大多是前列腺的良性增生性疾病，如果二者的比值明显下降，常常与前列腺的恶性肿瘤密切相关。临床上常常根据游离前列腺特异性抗原与总前列腺特异性抗原的比值，来鉴别前列腺疾病的良性或者恶性。