眼科平常常用的阿托品眼药水有1%或者是0.5%的阿托品眼药水，这种眼药水主要是用于做散瞳验光。一般来说，12岁以下的孩子做散瞳验光的时候，通常需要用阿托品眼药水来做睫状肌麻痹、散瞳验光，这样可以得到一个比较准确的屈光度数。
另外，阿托品眼药水还用于一些虹膜睫状体炎，当眼睛发生了前部葡萄膜炎的时候，需要用阿托品眼药水来控制炎症、缓解炎症，作为治疗性的作用。
还有，现在有一种低浓度的阿托品眼药水，比如0.01%的阿托品眼药水，它具有控制近视的进一步发展的功能。如果是近视眼的儿童、青少年，近视度数发展比较快，或者本身有高度近视的家族史，这一部分儿童需要在医院检查以后，在医生的指导下考虑用低浓度的阿托品，就是0.01%的阿托品眼药水来控制近视发展。
阿托品的副作用主要是滴完阿托品以后瞳孔会散大，瞳孔散大了以后，近距离阅读会受到影响，同时外出的时候光线强了会畏光。另外，滴用阿托品的时候，有的人会引起面部的毛细血管扩张，导致会有点面红，会引起一定程度的口干等一些副作用。如果是成年人用阿托品以后要注意，有的时候因为瞳孔散大，可能诱发眼压升高，引发闭角型青光眼的急性发作，这些都是它的一些常见的副作用。
