先天性肝囊肿一般要在长到足够大以致发生压迫症状或出现合并症时才引起注意。因此，通常需要做腹部超声、生化全项检查、腹部CT帮助检出。
1、腹部超声：是诊断肝囊肿简便易行的方法，可发现直径1 cm以上的肝囊肿，可确定囊肿病灶大小、数目、部位，确诊率超过95%；
2、生化全项检查：可观察患者肝功能是否受损，以及血液代谢情况，判断囊肿是否影响到肝功能；
3、腹部CT：可明确囊肿的数量、位置、大小以及与周围脏器、血管的关系。