南瓜发芽了，但是如果表皮和果肉没有出现变质的情况，一般还能吃。虽然发芽会降低南瓜的营养价值以及口感，不过也可以吃。
南瓜为葫芦科植物南瓜的果实，含有较多的类胡萝卜素、矿物质、果胶、氨基酸、纤维素，以及少量脂肪和碳水化合物。南瓜的营养价值比较高，适量食用有利于促进胃肠蠕动、促进新陈代谢、润肠通便、补充营养等。
南瓜果腔内富含水分，空气进入后容易导致南瓜种子发芽，但是无毒可食用。发芽南瓜的营养价值会大大降低，口感也会变差，所以具体是否食用看个人。如果想吃，建议去除发芽部分。
如果南瓜的表皮和果皮出现长毛、发霉并伴有酸臭味，说明已经变质，不建议食用，以免对胃肠黏膜造成刺激，引起炎症反应。