脊髓灰质炎后遗症主要因脊髓灰质炎病毒感染导致，患者及隐性感染者为其主要传染源，主要经粪-口传播，儿童好发，占90%以上。
病毒感染：脊髓灰质炎后遗症的病因是感染脊髓灰质炎病毒。感染后的脊髓灰质炎病毒主要侵袭脊髓前角运动细胞，造成肌肉松弛性瘫痪。患病1~2年之后畸形和病残将成为永久性，神经细胞不再恢复，受累部分神经所支配的肌肉瘫痪，同时软组织发生挛缩，肢体逐渐出现畸形，随着患儿生长畸形逐渐加重。