儿童脊柱结核的治疗原则是彻底清除病灶、解除神经压迫、重建脊柱稳定性、矫正脊柱畸形，促进患儿的恢复，预防后遗症的发生。
一、一般治疗
1、包括卧硬板床休息，病灶清除和椎间植骨术，术后可卧石膏床休息，这对术后护理和稳定脊柱均有帮助。
2、脊柱结核可以采取内固定方式进行稳定治疗；对不合作的儿童，为了限制其活动可考虑用石膏背心或支具固定。但石膏背心缺点多，对发育中的儿童需每3个月更换一次石膏，防止产生压迫褥疮。
二、药物治疗
抗结核治疗：一般采用两种抗结核药物联合应用，抗结核药物包括异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、链霉素、乙胺丁醇，3～6个月后改为单种抗结核药物治疗，整个疗程应不少于2年。
三、手术治疗
1、切开排脓：寒性脓肿广泛流注致患者出现继发性感染，全身中毒症状明显，不能耐受病灶清除术时可做切开排脓挽救生命。寒性脓肿被切开后，全身中毒症状可望得到控制，但切口极难愈合。没有继发感染的寒性脓肿不宜施行切开排脓手术。已形成的窦道因周围有广泛的瘢痕组织形成，并有炎性浸润，解剖结构不清，因此也不宜贸然施行瘘管切除术，以免损伤邻近血管、神经或重要脏器。亦不主张对寒性脓肿施行分层穿刺排脓及注射抗结核药物。
2、病灶清除术：后路手术通常用于胸椎结核。颈椎结核则多从前路进行病灶清除术，术后予以石膏固定3～4个月，复查后酌情拆除石膏或继续固定。
3、后路脊柱融合术：后路椎弓根螺钉系统与前路病灶清除术联合应用手术可以加强脊柱稳定性，并可使患者早期下床活动，术后3～6个月石膏背心固定。
4、前路脊柱融合术：病灶清除的同时植骨和前路内固定，达到即可脊柱稳定的目的，以利植骨融合。