治疗脑血栓的药物分几个时段，具体如下：
1、发病后3-6小时之间内时间短，可以进行溶栓用药治疗，这是目前治疗脑血栓最有效的办法，需要尽快到有溶栓条件的医院并在专科医生严格指导下用药。
2、发病六小时到十五天，需要住院神经内科专科医生进行应用改善脑供血、抗血小板集聚、降脂的药物。
3、发病十五天到六个月，患者脑血栓处于康复黄金期，需要在有康复条件的专科医院用药康复治疗。
4、六个月以后后遗症期，主要针对危险因素，比如高血压、糖尿病、高血脂等针对性用药，预防脑血栓再发，主要用降压药、降糖药、降脂药和抗血小板集聚的药物，将血压、血糖和血脂达标。