由于发作性嗜睡强食综合征的病因尚没有完全明确，治疗时目前仅针对临床症状进行治疗，用于缓解或控制疾病表现出的各种临床症状。
一、药物治疗
1、兴奋性药物：针对治疗发作性嗜睡强食综合征患者的嗜睡症状，常用的药物有莫达非尼、哌醋甲酯和苯丙胺。
2、利培酮：当发作性嗜睡强食综合征患者的精神症状持续而长久存在时，可使用利培酮治疗，该病对焦虑、抑郁的疗效较好，可能会有头痛、头晕等副作用。
3、金刚烷胺：部分发作性嗜睡强食综合征患者在发病的早期使用金刚烷胺能够使发病停止，同时，金刚烷胺也是一种抗病毒药物，对疑似由感冒引起该病的患者可考虑使用。
4、锂药物：对患者的情绪狂躁及抑郁有着姣好的疗效，常用的药物有碳酸锂片，但该药物对甲状腺及肾脏有一定的损害性，使用时需要密切关注这些脏器的功能情况。
5、丙戊酸：可用于治疗患者情绪狂躁。其疗效不如锂药物显著，但副作用少，肾脏及甲状腺功能不好的患者可选用。
二、手术治疗
本病以药物治疗为主，无需手术治疗。