结肠炎主的病因包括感染因素、遗传因素、过敏因素、自身免疫反应等。
1、感染因素：沙眼衣原体、志贺氏菌、疱疹病毒等病原体都会引起结肠炎症性病变。感染途径包括性行为、饮食等。
2、遗传因素：研究发现，四分之一以上的溃疡性结肠炎患者有家族病史。因此遗传的基因也被认为是引起溃疡性结肠炎发展的一个因素。
3、过敏因素：过敏因素主要针对存在有过敏性肠胃炎患者，其一旦接触致敏原后，也会引起肠道炎症反应，如牛奶、蚕豆、虾蟹等。
4、自身免疫反应：免疫系统是人体抵抗感染的防御能力。但是自身免疫系统一旦出现超敏反应，会对肠道细胞组织造成破坏性损伤，继而造成肠道炎症的发生。