大肠脂肪瘤的治疗属于短期治疗，药物治疗的情况较少，建议手术治疗，手术耗时短且无复发情况，通常预后良好。
一、药物治疗
1、肾上腺素类药物：去甲肾上腺素：本药具有加速患者基础代谢的作用，小儿、老年人、孕妇及运动员禁止食用，其他患者慎用，适用于术后出现低血压情况的患者。
2、脂肪乳注射液：本药有助于手术后的营养恢复，静脉注射，由患者体内脂肪量决定剂量，无不适人群。
3、小金丸：本药可以化瘀止痛，暂无不良反应，适用于感受剧烈阵痛的患者，运动员慎用，孕妇禁止服用。
二、手术治疗
1、微波凝固疗法：通过观察肿瘤的大小形态和位置进行活检，再用针状电极插入肿瘤内达到坏死的情况，可根治大肠脂肪瘤且不受肿瘤影响。
2、高频电凝圈套器摘除法：小于2.5cm的肿瘤选择该方法，使肿瘤块突起再收缩套圈用电凝切除，这样摘除肿瘤更加安全且不会引起大出血的意外状况。
3、外科手术治疗：适用于不能区分大肠癌和不适用内镜的患者使用。