早期诊断，早期确定孩子的性别身份，及时开展手术和激素治疗。此外，也要注重心理健康教育，才能在确保手术矫形成功的同时，帮助孩子更好地融入社会。
一、药物治疗
1、雌性激素：分为雌激素和孕激素两大类，可促进女性附性器官成熟以及第二性征的出现，并维持正常性欲以及生殖功能。
2、肾上腺皮质激素：女性假两性畸形需糖皮质激素替代治疗，调整剂量以维持尿17-酮类固醇于正常水平，可促进月经来潮、体毛发育。
二、手术治疗
1、外生殖器官矫正：将发育异常的外生殖器矫形成正常状态，如作女性者需要切除睾丸组织，作男性者需要切除卵巢组织、输卵管、子宫和增大的乳房。
2、乳房增大术：作女性者如果女性特征不明显，如乳房过小，可以通过手术的方式使患者乳房增大。
三、心理治疗
在治疗过程中，还应配合心理治疗。对患者进行心理健康教育，减轻患者精神上的负担。