慢性萎缩性胃炎是慢性胃炎的一种，有演变成胃癌的风险。
对慢性萎缩性胃炎的治疗，在根除病因的基础上，若是急性发作，可以选用抑酸剂、胃黏膜保护剂等对症治疗的药物进行短期症状缓解；但更重要的还是要选择能够缓解胃黏膜萎缩、肠化、异型增生的药物，从病理上进行治愈。
目前西医上没有明确能治疗胃黏膜萎缩的药物，中医药辨证治疗在这方面有一定优势，中医将慢性胃炎分为七种证型，随病情发展多以复合证候为主。患者可根据中医辨证，服用中药汤剂，如胃阴不足用一贯煎，脾胃湿热用黄连温胆汤等，但需及时调整处方和剂量。也可以选用中成药，服用更方便，但尽量选择能覆盖多种证型及复合证候的中成药，避免疾病反复。
另外慢性胃炎用药周期长，因此尽量选择组方药性温和，不含毒性、大寒或大热药物偏性的中成药，以免长期服用引起其他不适症状。