慢性肾盂肾炎可靠的诊断依据为泌尿系的影像学检查，其中包括肾脏彩超证实的双肾外形凹凸不平且大小不等；做泌尿系肾盂造影可见肾盂的变形或者狭窄。患有慢性肾盂肾炎还可造成持续性的肾小管功能损伤，比如低比重尿、肾小管酸中毒等，结合患者反复发作的肾盂肾炎病史，反复出现尿频、尿急，尿痛等尿路刺激症状，并伴有发热、乏力，腰痛不适等全身和局部症状可确诊。