对于阴道粒细胞肉瘤来说，目前单一治疗效果较差，多以手术治疗、放化疗和干细胞移植等综合治疗为主要的治疗方案。
一、药物治疗
50%以上单发性尤文氏肉瘤患者经过以化疗为主的综合治疗后可以治愈。目前化疗主要运用环磷酰胺、长春新碱、阿霉素、放线菌素D、异环磷酰胺、依托泊苷等。近十年来，IFO和VP-16在尤因肉瘤化疗中收到良好疗效。
二、手术治疗
1、单纯局部手术切除：对于病变范围较小的阴道粒细胞肉瘤，适合采取本方案，手术后结合放化疗综合治疗可有效防止复发。
2、部分阴道或全阴道切除术：对于病变侵犯程度较深，又尚且未发生盆腔转移的患者，考虑采用部分阴道或全切除术进行治疗，阴道切除的同时医生也会做阴道成形术。
3、广泛子宫切除、部分阴道切除、盆腔淋巴结清扫术：对于肿瘤侵犯程度较深，侵犯范围较广，以及已经发生盆腔转移的患者，会建议采取该手术方式。
三、放射治疗
尤因肉瘤对放疗较敏感，该方法通过照射可使肿块减小，患者的局部症状得以减轻甚至消失，而且可改善无法进行手术的患者的预后，大大提高患者的生存质量。但单独应用的远期疗效很差。
四、化学药物治疗
化疗常用的药物有伊达比星、阿糖胞苷等，常在综合治疗中联合手术和放疗使用，能够有效抑制肿瘤的生长和扩散、杀死肿瘤细胞。
五、其他治疗
干细胞移植治疗是把健康的干细胞移植到患者体内，以达到修复或替换受损细胞或组织，从而达到治愈的目的，是一门先进的医学技术，目前对于中高危白血病患者来说，异体移植是重要的根治手段。