亚急性心内膜炎选择中西医共同结合治疗。西医方面主要是选择应用足量和足够疗程的抗菌药物，首选青霉素类的药物，建议静脉输液治疗，必要时可以与链霉素药物共同治疗。同时可以配合中医疗法，应用清热解毒的药物，例如六神丸、点舌丸、黄连上清丸等。有心脏瓣膜疾病的患者，平时要注意卫生，及时清除感染病灶，避免引起这种疾病发生。