卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，比较常见的是黄体囊肿、滤泡囊肿等。黄体囊肿是由于排卵后形成黄体，没有及时吸收而形成囊肿。盆腔炎导致输卵管卵巢脓肿，导致囊肿的发生。病理性囊肿比较常见的是上皮性肿瘤、生殖细胞肿瘤、卵巢性索间质肿瘤、转移的肿瘤。以上皮性肿瘤为代表，发病原因认为是卵巢浆液性肿瘤，大多起源于输卵管的病变，导致卵巢肿瘤的发生。上皮性肿瘤可能跟遗传因素也有关系，比如家族性卵巢癌和乳腺癌的患者会有遗传因素，子宫内膜异位症恶变会导致卵巢子宫内膜样肿瘤或者透明细胞癌，持续排卵会导致卵巢上皮不断的损伤和修复，可能会增加卵巢肿瘤的发生。