IgA肾病的分级是以光学显微镜下肾小球肾间质损害的程度进行分级，有Lee分级和牛津分级。Lee分级分为五级：
1、Ⅰ级肾小球大多数正常，轻度系膜增宽，不伴细胞增生。
2、Ⅱ级肾小球局灶系膜增殖和硬化，肾小管和肾间质无损害。
3、Ⅲ级肾小球呈弥漫性系膜增殖和增宽，可以见到小的新月体，以及局灶性肾间质水肿和肾小管萎缩。
4、Ⅳ级肾小球病变呈重度弥漫性系膜增生和硬化，全部肾小球硬化，小管萎缩和间质浸润。
5、Ⅴ级及肾小球病变更为严重，新月体形成大于45%，肾小管和肾间质病变更为严重。
牛津分类法采用M、E、S、T四项指标，是目前临床上最常用的IgA肾脏病理诊断标准，四项指标的所指是M系膜细胞增殖，E毛细血管内皮细胞增生，S局灶节段硬化，T肾小管萎或者间质病变纤维化等是预测预后最主要的因素。