会厌囊肿主要是通过手术切除来治疗，如果是小的会厌囊肿不做手术是可以的，可以通过观察的方式来进行随诊。小的会厌囊肿可能并不会引起明显的症状，通常在喉镜检查中发现，对于大的会厌囊肿建议进行手术，因为大的会厌囊肿可能会引起咽部的异物感、吃饭的梗阻感或者引起呛咳，甚至有的会引起呼吸的困难。所以如果不做手术的话，随着囊肿的进一步增大，这些症状的可能会越来越明显，如果影响到呼吸的话甚至有生命危险。