自身免疫性胰腺炎的诊断标准，各地的标准有所差异，以亚洲标准为例，具体如下：
第一、影像学检查：胰腺实质要呈局灶性或弥漫性增大，并且伴有包块或低密度的边缘。针对胰胆管，影像学上会呈现局限性或弥漫性狭窄，并且常合并胆管的狭窄。影像学以上两条必备，属于自身免疫性胰腺炎在影像学上会导致的改变。
第二、血清学上的检查：抽血检查IgG及IgG4会呈现高水平，或者有其他自身免疫性抗体呈现阳性，而血清学检查只需要具备一项就行。
第三、组织学检查：如果能够有组织学的检查就更具有准确性了，取得胰腺的组织病理并进行检测，发现有淋巴浆细胞浸润伴有纤维化，并且有大量IgG4阳性的细胞浸润。另外，如果能有标本学病理学检查，也是比较准确的诊断标准。