甲状腺乳头状癌患者在手术以后，一般需要吃药治疗。甲状腺癌手术以后，多数患者可能需要进行放射碘治疗，在此间隔时间不一定，有的要尽快进行，有的可能会维持一段时间。在此期间，可能部分患者需要服用甲状腺素片，在服碘之前一般停用一个月，服碘之后再继续加用。患者通过服用甲状腺素片来抑制TSH的水平，预防甲状腺癌的复发，减少复发几率。
为了减轻甲状腺乳头状癌手术以后颈部的不适症状，包括水肿、颈部紧缩感，以及声音嘶哑，可以应用治疗神经病变的药物，来营养局部神经，并减轻水肿。部分患者在术后会出现甲状腺功能减退，继而出现血脂的代谢异常，所以部分患者需要注意应用调节血脂和补钙的药物。