由于阴茎属于体表的组织器官，因此，当阴茎发生恶性肿瘤的时候，从外观即可以看到异常的表现，此时采用医生常规的体格检查，结合必要的影像学检查，如超声检查即可以获得一个初步的诊断意见。部分患者还也可以采用盆腔局部CT或者MRI检查，明确病变的侵袭范围和侵袭病灶大小。对于临床确诊检查，主要依赖于阴茎局部病灶的组织病理学检查，或者实施脱落细胞学印片，病灶局部分泌物中肿瘤细胞查找等手段进行。