扁桃体发炎一般是由于细菌的感染所引起的，在治疗时一般可选用一些广谱的抗生素例如阿莫西林等。在条件允许的情况下，可以使用细菌培养的方法来确定致病菌，然后选择该菌敏感的抗生素，这样效果更好。但是，由于培养细菌需要很长的时间，此种方法只适用于病情不严重的患者，病情严重时，例如扁桃体出现了严重的化脓，则应该使用一些三代头孢进行治疗。