费尔蒂综合征不能彻底治愈，其治疗与类风湿关节炎治疗类似，需要长期治理，应用抗感染、药物治疗等方式，严重者需要进行手术治疗，主要目标是达到临床缓解或降低疾病活动度。
一、一般治疗
对于合并感染的患者，建议根据感染部位及病原菌及时应用抗感染治疗。粒细胞刺激因子可作为支持性治疗改善中性粒细胞减少。
二、药物治疗
1、糖皮质激素：是控制疾病的首选药物，但存在不良反应，如向心性肥胖、血糖血脂增高、高血压、诱发和加重溃疡、股骨头坏死、骨质疏松等。为避免副作用，可加用保护胃黏膜药物，同时服用钙剂和维生素D，坚持运动。
2、抗风湿药：不具备明显的镇痛和抗炎作用，但可延缓和控制病情进展。该病一经确诊，应早期使用药物。
（1）甲氨蝶呤（MTX），是目前应用最多的药物，可以控制骨的破坏速度但不能修复骨破坏程度。治疗初期注意胃肠道反应、黏膜糜烂，长期用药注意检测肝功能。指导病人补充叶酸可减少副作用。
（2）柳氮磺吡啶，用药前详细询问病人有无磺胺过敏史，如无方可使用。副反应包括头晕、全身不适等，少见的副作用主要是特异性的超敏反应。少数男性出现暂时不育症，停药可恢复。用药期间需严密监测肝功能。
（3）来氟米特，属于新型的免疫抑制剂，具有抗感染的功能。毒副作用主要有胃肠道反应、脱发、肝功能损害、体重减轻等。指导病人饭后服药，密切监测肝功能。该药有致畸作用，孕妇禁用。
（4）雷公藤总苷，具有抗感染和免疫抑制作用，但也具有抑制性腺的副反应，其他副作用包括胃肠道反应、肝功能损害、白细胞下降等。指导病人饭后服药，密切监测肝功能、血常规。
（5）抗疟药，包括羟氯喹和氯喹，前者应用较多。肝、肾相关副作用较小，无需常规检测。用药前和治疗期间需检查眼底，以监测该药可能导致的视网膜损害。
3、非甾体抗炎类药物：具有镇痛抗炎作用，是缓解关节炎症的常用药，但控制病情方面作用有限。应与抗风湿药同服。选择药物需注意胃肠道反应等，避免两种或两种以上非甾体抗炎类药物同时使用。而且该类药物会增加心血管事件的发生，因而应谨慎选择药物并以个体化为原则。
4、生物制剂：是近几十年治疗的一个重要进展，常用的包括TNF-α拮抗剂、IL-6拮抗剂等。其主要副作用包括注射部位反应和输液反应，可能增加感染，尤其是结核感染的风险。用药前应筛查结核，除外活动性感染和肿瘤。
三、手术治疗
1、脾切除术：脾切除术后约有80%的患者周围血常规可获得改善，抗感染和关节炎症也可有所改善。该术适用于激素治疗无效，且粒细胞数低于1.0×109/L的患者，以及伴有严重贫血、血小板减少或反复感染者。
2、人工关节置换及滑膜切除术：人工关节置换术适用于较晚期有畸形并失去功能的关节。滑膜切除术可以使病情得到一定缓解，但当滑膜再次增生时病情又趋复发，所以必须同时应用抗风湿药。