胰腺穿刺活检有风险，其风险如下所示：
1.腹痛和腹膜炎：最常见，一般症状轻微，短时间内可缓解。少数因胰瘘、胃肠液漏形成腹膜炎，轻者禁食、补液、抗感染，使用减少消化液分泌的药物，重者留置引流管，按外科急症处理。
2.出血：穿刺次数增多，活检枪激发后的弹射距离增大会损伤深部血管造成出血。
3.感染：若消毒不当可造成感染。
4.腹腔脏器损伤：穿刺活检术可能会误伤胰周血管、胆管、肠管或其他肝外器官，而引起严重出血、胆汁漏、气腹等并发症。
5.针道种植：射程长、穿刺距离长、穿刺次数较多、活检针外径粗会造成肿瘤的针道种植。