颅骨修补本身不会产生后遗症，患者的后遗症主要来自之前的大脑疾病，如脑外伤、脑出血等。
颅骨修补是通过修补缺损的颅骨，来消除大气压对大脑的压迫，改善大脑的血流量，不仅不会产生后遗症，反而有利于之前后遗症的恢复。但是要明确的一点是颅骨修补术虽然不会产生后遗症，但是具有一定的手术风险，会产生相关的手术并发症，跟后遗症是不同的概念。颅骨修补术比较常见的并发症主要包括颅内出血、钛板感染、皮下积液、癫痫等，大部分并发症都比较轻微，通过药物治疗都能得到治愈，但是也会产生比较严重的并发症，如弥漫性脑肿胀、颅内大量出血等。尽管总体发病率很低，但是这些并发症一旦出现，可能会危及生命，造成患者死亡。