对于食管囊肿在通常情况下是不会发生癌变的，它是一种良性瘤样增生性病变。食管囊肿可分为先天性囊肿和潴留囊肿，而先天性囊肿一般内衬柱状上皮、纤毛柱状上皮、鳞状上皮或多种上皮；而潴留囊肿是由于腺体导管狭窄或梗阻而导致腺体扩张，引起液体潴留而形成的囊肿。当肿瘤体积非常小，症状不明显时，可以临床观察，不需要特殊处理。但是若食管囊肿不断增生增大，患者会出现反酸、恶心、呕吐、哽噎感等症状时，则需要进行手术切除治疗，预后较好。