酪酸梭菌活菌胶囊是属于正常的微生态药物，人体摄入胶囊以后可以通过它的作用，维持肠道正常的厌氧环境，从而促进有益菌，比如双歧杆菌、乳杆菌的生长，也可以抑制有害菌的生长，所以微生态制剂主要的作用就是维持肠道的正常的环境，对于缓解便秘、腹泻都有一定的作用。
对抗生素引起的相关性腹泻的作用更强，由于是活菌制剂，所以不能跟抗生素同时服用，抗生素能直接消灭，不能发挥正常的作用，如果要用最好要隔开数小时以上。