肠系膜动脉瘤主要病因是感染，由于真菌及细菌感染的菌栓栓塞了动脉血管，造成血流异常，引起某一部位动脉扩张形成动脉瘤。此外，动脉粥样硬化、高血压、门脉高压症也可引起血流异常、动脉扩张，从而造成肠系膜动脉瘤。
一、主要病因
1、感染：占病因的57%，主要为真菌感染、细菌性心内膜炎感染，感染造成的菌栓堵住血管，造成某一部位的血管局部扩张形成动脉瘤。
2、动脉粥样硬化：动脉粥样硬化使血管内膜损伤、血流动力学异常、局部血管扩张，形成动脉瘤，多发生在59岁以上的中老年人。
3、门脉高压症：也可损伤血管造成血流动力学异常，使血管局部扩张形成动脉瘤。
4、高血压：高血压可以导致动脉粥样硬化，也可以损伤血管内皮，造成血流学异常，形成动脉瘤。
5、先天性动脉发育不良：先天性动脉发育不良和外伤等，也为本病的发病原因，但临床较少见。
二、诱发因素
1、抽烟：大量吸烟与动脉粥样硬化的发生密切关联，从而导致肠系膜动脉瘤发生。
2、饮酒：酗酒损伤血管，促进动脉粥样硬化，是动脉瘤形成的诱因。
3、劳累：劳累是动脉瘤破裂出血的诱发因素。
4、剧烈运动：剧烈运动引起需氧量增加，是动脉瘤破裂出血的诱发因素。