碳14呼气试验可能会带来放射性危害，但危害并不是特别大。如果只是偶尔检查一次，并不会造成太大危害，但如果长时间频繁检查，就有可能会带来一定的辐射。
碳14呼气试验是幽门螺杆菌感染常用的方法，但在进行本项试验前，需凉饮用水送服1粒C14胶囊。而C14本身有微量放射性，需要在医生知情告知下并满足相应的适应证的前提下行本操作，以免导致放射性损伤。