甲状腺乳头状癌早期通常没有明显的症状，病人通常是在体检时超声发现或者是无意中摸到甲状腺结节。当肿瘤增大到一定的体积，可在颈部发现肿物，或者是肿瘤引起疼痛，憋胀不适等症状。晚期肿瘤可侵犯周围的组织器官，比如侵犯气管引起咳嗽，呼吸困难，侵犯食道，出现吞咽困难，吞咽时疼痛，侵犯喉返神经，出现声音嘶哑，饮水呛咳，有淋巴结转移者可在颈部发现肿大的淋巴结。个别病人的原发灶症状并不明显，而是因为颈部淋巴结或其他部位的的转移才发现。晚期肿瘤还可以通过血行或淋巴转移至肺，骨，从而引起咳嗽，痰中带血，胸痛，骨骼疼痛等相应的症状。