艾灸早晨和晚上都可以做，但是应该注意，艾灸最好别在晚上九点钟之后做，因为太晚艾灸不好。应当根据病症的不同，来选择艾灸的时间，如果单纯补阳气，一般上午艾灸更好。当然，根据不同体质，艾灸的时间也不一样，调理脾胃功能可以在早上9-11点灸，养肾在下午5-7点灸，失眠症要在临睡前施灸，不要晚于九点。
人体的阳气与自然界阴阳消长的变化密切相关，早上阳气生发，中午阳气最盛，晚上阳气潜藏，毛孔闭合，人体要根据自然界的变化来安排饮食起居。中医养生讲顺天时，晚上艾灸实际上违背了自然规律，如果晚上艾灸过量，会出现阴虚的症状，比如出现五心烦热、面红、失眠盗汗、口燥咽干、眩晕、耳鸣、舌红少苔、大便干结、鼻腔湿热、口腔溃疡、神疲消瘦等。