婴儿上吐下泻的原因如下：1.肠道感染，包括细菌、病毒和真菌感染，细菌感染包括大肠杆菌、志贺氏菌、伤寒沙门菌、空肠弯曲菌等，病毒感染比如轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒等。2.肠道外感染，比如上呼吸道感染、支气管肺炎、皮肤感染、中耳炎等急性感染性疾病，由于病原体毒素的影响，胃肠功能紊乱出现上吐下泻；3.饮食因素、气候因素和过敏因素等非感染因素，比如喂养不当、腹部受凉、牛奶蛋白过敏等。