五羟色胺又名血清素，五羟色胺的作用体现在以下几个方面：
一、五羟色胺在免疫系统中的作用，五羟色胺可以结合人体免疫细胞表面不同的五羟色胺受体，调控免疫系统。
二、五羟色胺在中枢神经系统中的作用，中枢神经系统的五羟色胺及其受体表达的降低，与抑郁具有一定的相关性。研究发现适当增加脑内五羟色胺水平，可以有效减轻抑郁症的症状，说明中枢神经系统内的五羟色胺的降低，可以导致抑郁的发生。
三、五羟色胺在咽喉反流性疾病的作用，五羟色胺可以直接影响消化系统多个器官的功能，食管内的五羟色胺的缺乏与胃食管反流性疾病、反流性食管炎有一定相关性。