腔隙性脑梗死急性期可以考虑使用阿替普酶进行溶栓，后续使用丁苯酞、依达拉奉等药物进行脑保护，并且使用控制血压、血糖、血脂的药物，如阿司匹林肠溶片、阿托伐他汀等药物对症支持治疗。
非急性期的腔隙性脑梗患者如果有基础疾病，需要用上述药物治疗基础疾病和预防脑梗治疗。如果患者没有高血压、糖尿病、高血脂等基础疾病疾病，可以不用药物，需要调整心态、生活习惯、饮食习惯，以及戒烟、戒酒、适当运动。