贲门癌不能做手术治疗，也就意味着患者病变范围广，或有远处转移，为疾病的晚期，这类病人需要行全身治疗控制病情，包括全身化疗、靶向治疗等。
根据国内外文献报道和临床数据统计结果，一般晚期贲门癌患者全身化疗后，中位生存期大多为11个月左右。而若是HER2(+)的贲门癌患者行曲妥珠单抗联合紫杉醇或多西紫杉醇治疗时，中位生存期为16个月左右。若上述治疗无效，患者疾病进展，再行阿帕替尼靶向治疗，则中位生存期为3-6个月左右。