在临床上，用于治疗肺结核的二线药物主要包括利福喷丁胶囊、利福布汀胶囊、硫酸丁胺卡那霉素注射液、左氧氟沙星片、盐酸莫西沙星片、环丝氨酸胶囊以及对氨基水杨酸制剂等，还有近期应用于抗结核的富马酸贝达喹啉片、德拉马尼片以及利奈唑胺片等新药。
治疗肺结核一线药物主要包括经典的异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇以及链霉素等，二线药物主要是在一线药物出现复治、耐药或者对一线药物的副作用不能耐受的情况下，来联合进行治疗。二线药物相对一线药物，副反应更多，应用期间需要密切观察病人的反应。