腘窝囊肿手术方法有传统开刀囊肿切除手术和膝关节镜手术，传统开刀手术费用在五千块钱左右，需要在腰麻下进行手术。传统手术创伤较大恢复较慢，切口愈合后瘢痕大影响美观，但费用相对较低，不过其治疗较彻底复发概率低。而膝关节镜微创手术，创伤小、恢复快、瘢痕小、但手术费用相对较高，需要10000左右，且术后复发概率较传统开刀手术稍高。