十二指肠胃反流及反流性胃炎多由于胃、幽门、十二指肠解剖结构异常及运动功能紊乱、胆囊功能异常等因素，使十二指肠内容物、胆汁、胰液及碱性肠内容物反流入胃，从而削弱胃黏膜屏障功能，造成胃黏膜损伤。
一、主要病因
1、胃、幽门、十二指肠解剖结构异常及运动功能紊乱：胃、幽门、十二指肠的协调运动有阻止十二指肠内容物反流入胃的能力。由于胃切除手术后，缺少幽门括约肌的作用，导致过多的胆汁反流入胃致胃黏膜损伤。
2、胆囊功能异常：胆汁反流性胃炎的患者消化期间胆囊排空不良，消化间期胆囊潴留胆汁明显增多，餐后胆囊排出量及最大胆囊排出量明显减少。
3、胃黏膜屏障功能受损：十二指肠胃反流液中的胆盐及胰液成分能有效地破坏胃黏膜屏障，胆汁和胰液混合后，胆汁中的卵磷酯通过胰液中磷酸酯酶A的作用转化为溶血卵磷酯与胆酸一起反流入胃，可显著降低胃表面黏液的黏滞性及弹性。反流物中胆汁、胰液等成分与胃酸、胃蛋白酶对胃黏膜的损害可能有协同作用。
4、肝胆疾病：患有肝脏疾病的患者存在门静脉高压，可以引起胃泌素释放不足而导致十二指肠反流。患有胆道疾病的人胆汁会持续不断排入十二指肠而导致反流入味。
5、其他因素：平时精神紧张、吸烟酗酒、长期生活不规律会导致胃肠道激素分泌紊乱而引发本病。
二、诱发因素
1、吸烟：长期吸烟可以影响幽门括约肌功能，引起十二指肠胃反流。
2、不良生活习惯：暴饮暴食、过度饮酒、精神紧张等生活规律变化引起胃肠激素分泌紊乱而致的十二指肠胃反流。