吃了发霉的面包可以通过口服抗生素、益生菌，以及奥美拉唑，来治疗发霉面包导致的急性胃肠炎，此外还需要多饮水来中和发霉面包的毒素，防止导致肝肾损害。发霉的面包会产生较多的黄曲霉素，以及真菌和细菌的感染，如果出现了进食之后有上腹疼痛、腹泻、呕吐等症状，考虑是因为发霉的面包导致急性胃肠炎，对这种情况可以化验血常规和大便常规，来判断是否存在有细菌感染的现象，必要时可以给予抗生素进行抑制细菌的感染，常用的抗生素有左氧氟沙星等。
还可以给予益生菌调节肠道菌群，改善腹泻、呕吐症状，腹泻严重的还可以口服蒙脱石散止泻治疗，也可以口服奥美拉唑抑制胃酸，保护胃黏膜，减轻胃部不适的症状。此外发霉的面包中还含有较多的黄曲霉素，黄曲霉素对肝脏损害比较大，是肝癌的诱因。如果吃了大量的或者反复的进食发霉面包，要考虑黄曲霉素对人体的损害，要大量饮水促进毒素的排出，同时要监测肝功能和肝脏的超声检查，来判断肝脏的手术情况。如果是偶尔进食了发霉的面包，大量的饮水促进毒素排出之后，对肝脏影响不是太大。出现了面包发霉的情况，先是要避免进食发霉的面包，减少其对人体的损害。