怀孕早期雌二醇低的危害有以下几点：
1、可能会导致先兆流产，在怀孕的初期，正常来说孕妇孕酮数值要保持上升的状态，但如果有流产症状的时候，孕酮就会有下降的趋势。
2、宫外孕的可能，如果怀孕以后孕酮下降、雌二醇低，可能是因为宫外孕引起，应及时检查HCG的翻倍情况，做B超检查进一步确诊。在临床上孕早期如果孕酮值高于20ng/mL，就能排除宫外孕。如果孕酮值低于10ng/mL，雌激素水平也非常的低，就有宫外孕的可能。建议在早期要足够的重视，及时的查HCG翻倍情况，做B超检查以协助明确诊断。