百日咳的特效药主要有以下几种：1、红霉素，这是治疗百日咳的首选药，根据患者病情轻重选择口服或静脉输入，但是新生儿不推荐，有导致肥厚性幽门狭窄的风险。2、阿奇霉素，对百日咳杆菌是比较敏感的，能起到很好的治疗效果。3、患者如果痰液较多，可以服用复方鲜竹沥液、氨溴索口服液。如果是刺激性的干咳，可以服用枸橼酸喷托维林片、复方甘草片。