阴茎短小可以做激素六项检测，如果激素六项检测发现睾酮水平较低时，常提示睾丸间质细胞分泌睾酮水平较低，可以局部补充雄激素治疗。通过局部口服十一酸睾酮治疗，可以改善雄激素降低引起的阴茎短小症状。阴茎短小还可以做阴茎包皮环切术，通过包皮环切手术使龟头外露，经常受内裤摩擦会刺激龟头，从而刺激阴茎进一步生长发育，通过包皮环切术还可以减少包皮龟头发生反复感染。