胰高血糖素瘤综合征无特效药物治疗，对确诊患者，宜争取时间进行手术切除肿瘤治疗。对恶变且广泛转移者，只能用化疗。因胰高血糖素瘤属可复发可转移，患者的治疗周期普遍较长。
一、药物治疗
1、皮损局部可用糖皮质激素制剂，近年来使用锌剂及肾上腺皮质激素外用也有缓解皮肤病变症状，但对其他症状无效。
2、靶向治疗，现用靶向治疗来抑制肿瘤生长，可用依维莫司、舒尼替尼等药物。
二、手术治疗
手术切除肿瘤：这是唯一而有效的方法。切除瘤体第二天皮肤病变即有显著好转，二周内可全部消失。如恶性者即使不能全部切除肿瘤，做部分切除疗效也佳。
三、化学药物治疗
对不能手术切除或有转移者可选用化疗，应用链佐霉素或(和)氟尿嘧啶可使病情明显缓解，血胰高血糖素下降，瘤体缩小。皮肤病变应用皮质激素有较好效果，但可使糖尿病患者病情恶化，应慎用。