异位肾是否需要治疗主要根据肾脏位置、对周围脏器的影响、有无严重并发症来决定，如果无明显症状可不做特殊治疗。治疗原则主要治疗并发症，并非治疗异位肾本身。
一、药物治疗
左氧氟沙星：根据泌尿系感染情况，以及有无发热等全身症状，选择敏感抗生素口服或者静脉滴注，常用左氧氟沙星。
二、手术治疗
1、肾积水或积脓：异位肾导致重度肾积水或积脓时，需手术治疗。由于异位肾的血管常分成多支，多直接来自腹主动脉和盆腔血管的主干，且输尿管无足够的长度，复位往往有困难，故需要进行切除。
2、肾结石：对于导致反复泌尿系感染，以及重度肾盂积水的肾结石，需要及时处理，治疗方法按照对人体损伤由小到大的程度，分为体外冲击波碎石术、经输尿管软镜钬激光碎石术、经皮肾镜碎石术。
3、肾输尿管肿瘤：对于局限在肾脏内、分期较早、条件合适的肿瘤，应选择肾脏部分切除术，尽可能保留剩余的肾单位和肾脏功能。
三、其他治疗
尿液引流：患者的肾脏积水会对脏器造成永久损害，因此需要及时将潴留的尿液引流出去。